目前枣庄市建设委员会内设机构有：办公室、人事科、综合财务科、城市建设科、工程建设科、科教设计科、政策法规科、村镇建设科、住宅与房地产业科9个职能科室和离退休干部科、工会、机关党委、市监察局驻市建委监察室。机关编制总额为44名（实有40名），其中行政编制34名，离退休干部工作人员编制5名，工勤人员编制5名。

    （一）办公室
    协助委领导组织协调机关日常工作，负责文秘、档案、保密、保卫、信访、信息、督办、提案及会议组织和综合性文稿的起草、后勤服务工作；负责机关资产管理；管理城市建设档案等工作。
    （二）人事科
    负责委机关和直属单位的人事、劳动工资管理；负责建设行业专业技术人员职业资格管理工作。
    （三）综合财务科
    组织编制全市建设事业发展战略、中长期发展规划和计划；负责行业统计工作；负责辨证城建资金年度使用计划；负责机关财务、国有资产管理，指导监督直属单位财务和国有资产管理；负责审计调查和经济分析，对委属单位财务收支、经济责任和国有资产保值增值进行审计、核定。
    （四）城市建设科
    拟定全市城市建设和市政公用事业的发展战略、规划和有关规定、办法，指导全市城市供水、燃气、热力、公共客运、市政设施、城市雕塑、园林、绿化、市容和环卫工作；负责对国家和省市重点风景名胜区及其规划的审查报批和保护监督工作；指导城市规划区内生物多样性工作；指导城市规划区内地下水的开发利用与保护；指导城市环境综合治理、城建监察和防洪排涝工作，指导城市计划用水、节约用水和城市规划区地下水的开发利用与保护及污水处理工作。
    （五）工程建设科
    负责规范建设市场各方主体的时常行为及工程招标投标、工程质量、施工安全、合同管理和工程风险管理的规章制度的制定和监督执行；负责建设监利、施工许可和竣工验收备案工作；组织指导工程建设标准定额与造价工作；指导产品质量认证工作；负责境外企业进枣承包工程管理工作。
    （六）科教设计科
    研究拟定建设系统科技教育发展战略和规划；组织新技术、新产品、新材料的研究、开发和推广应用；负责建设技术市场管理工作，组织科技合作项目的实施及引进技术的消化、吸收和创新；组织指导建设系统职工教育及转移技术人员的岗位培训工作；负责全市建设系统对外经济技合作，组织指导建设系统对外招商引资工作，办理有关涉外事宜；负责全市城市建设利用外资项目的有关协调工作；综合管理全市工程建设和城乡建设勘察设计工作，拟定全市勘察设计行业的发展规划和有关规定；组织制订国家、省和市投资的基本建设项目的初步设计方案；管理工程建设标准设计工作；负责勘察设计单位资格审核报批、管理工作；规范勘察设计市场、管理标准设计工作；监督实施各类房屋建筑及其附属设施和城市市政设施的建设工程抗震设计规范，综合管理全市城镇建设及工业与民用建筑的抗震设防工作；指导城市地下空间的开发利用，负责城市民用建筑结合修建人防工程的管理工作。
    （七）政策法规科
    组织拟定全市建设行业规范性文件、规章并组织实施；负责综合性政策的调查研究；负责建设行政执法和行政复议工作；指导建设系统的法制建设和宣传教育工作。
    （八）村镇建设科
    拟定全市区（市）以下建制镇、集镇和村庄建设的规范性文件；组织辨证和监督实施全市村镇建设的中长期规划和重点小城镇的总体规划；指导村镇建设工作，组织村镇建设试点；指导受灾地区的村镇重建和大型建设项目地区的村镇迁建工作。
    （九）住宅与房地产业科
    指导规范全市房地产市场；指导城镇土地使用权有偿转让、开发利用和房产登记发证工作；拟定全市住宅建设与房地产业的中长期规划、科技发展战略、产业规定和规章，拟定住宅建设、房屋拆迁、房地产开发、房地产市场、房地产评估、物业管理的规章制度并监督执行；指导全市住宅建设和住房供应政策的实施；组织实施房地产开发企业、物业管理企业、社会中介服务机构资质标准；指导城镇住房制度改革工作。
    离退休干部科：负责委机关及指导直属单位离退休人员的管理服务工作。
    工会：负责所属基层单位及本机关的工会工作。
    机关党委：负责机关和直属单位的党群、女工和计划生育工作。
    纪检监察室：主要担负落实党风廉政建设责任制，对全委落实党风廉政建设责任制情况进行监督监察与专项考核，以及依法行政、自身建设、防腐治腐、党风廉政教育等职能。

    下属县级事业单位：
    1、枣庄市住房制度改革办公室（1993年4月成立，1999年11月更名为枣庄市住房委员会办公室）
    2、枣庄市市政园林管理局（1999年7月成立，2004年5月更名为枣庄市市政园林管理局）
    3、枣庄市城市建设监察支队（1998年8月成立，2004年3月撤消）
    4、枣庄市建筑业管理局（2001年6月由枣庄市建筑工程管理处更名升格后成立）
    5、枣庄市城市建设投资开发中心（2000年9月成立）
    6、枣庄市房产管理局（2001年6月由枣庄市房产管理处更名升格后成立）
    7、枣庄市建设培训中心（1985年7月成立，2004年3月由枣庄市城乡建设职工中等专业学校更名成立）
    8、枣庄市城市规划局（2001年6月由枣庄市城市规划管理处更名成立，2004年4月更名为枣庄市城市规划局，并由副县级事业单位升格为正县级事业单位）